AI+生物,深圳大学 实现RNA适配体高效进化,一轮搞定 化学抗体
来自 实验室仪器网
近日,深圳大学人工智能学院张军助理教授联合天津大学、中科院深圳先进院团队,在国际顶级期刊《Nature Biotechnology》发表重要成果,创新性提出GRAPE-LM生成式AI框架,首次实现RNA适配体的一轮式高效进化,深圳大学为第一完成单位。
RNA适配体被誉为“化学抗体”,在疾病诊断、靶向治疗、生物传感等领域应用价值极高。但传统指数富集筛选技术需多轮人工操作,耗时数周至数月,且多在体外溶液中开展,难以还原细胞内真实环境,实际应用效果受限。
现有胞内筛选虽更贴近生理环境,能提升分子相关性与特异性,但受转染效率、细胞摄取量限制,文库规模与筛选通量存在明显瓶颈,大量高活性序列易被遗漏。针对这一难题,团队将AI“数字进化”与细胞内筛选结合,破解通量与效率双重局限。
团队研发的GRAPE-LM框架,融合核酸语言模型与条件自编码器,以单轮CRISmers胞内筛选数据为活性指导,仅通过一次实验,就能高效进化出性能优于传统多轮筛选的RNA适配体。该方法把长达数月的流程压缩至单次试验,大幅简化研发周期、降低成本。
更关键的是,AI生成能力突破传统文库容量限制,可从有限实验数据中挖掘出更优候选分子,弥补胞内筛选通量不足的短板,从源头提升适配体活性与特异性。这项成果打通“AI+合成生物学+生物医药”链条,为快速开发面向重大疾病靶点的高亲和力RNA药物、精准诊断试剂、高性能生物传感器提供全新技术路径。
该研究不仅是RNA适配体研发范式的革新,更展现出AI在生命科学与精准医疗领域的强大赋能作用,有望加速新型核酸药物与诊断工具的落地进程,推动我国在RNA therapeutics领域实现前沿领跑与自主创新。
文章标签:核酸适配体RNA适配体单轮筛选科学科研动态 评论收藏分享
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